اگرچه جهت اصلی پژوهشی در مرکز تحقیقات نقص ایمنی،پژوهش در زمینه بیماریهای نقص ایمنی است ولی حسب علاقه و زمینه فعالیت اعضاء هیئت علمی و پژوهشگران مرکز تحقیقات، گروههای کاری مختلفی شامل: کمبودهای آنتی بادی، نقص ایمنی توام، نوتروپنی، CGD، آتاکسی تلانژکتازیا، رجیستری بیماریهای نقص ایمنی و گروه آزمایشگاه تشخیص ملکولی RCID تعریف گردیده است. بمنظور افزایش بهره وری و اجتناب از موازی کاری، توجه و رعایت نکات زیر توصیه میگردد
این مرکز تنها سازمان در نوع خود در آسیا و خاورمیانه است و عضو انجمن بین المللی بیماران مبتلا به نقص اولیه ایمنی( IPOPI) است.