یکی از مقاطع تحصیلی بالا در آموزش عالی است که به اعطای مدرک دکتری تخصصی پژوهشی (PhD. by Research ) می انجامد . مرکز تحقیقات نقص ایمنی دانشگاه علوم پزشکی تهران با هدف جذب و تربیت پزوهشگران در زمینه بیماری های نقص ایمنی اقدام به برگزاری برنامه تربیت دکتری تخصصی پژوهشی، مصوبه سی و هشتمین جلسه شورای عالی برنامه ریزی نموده است . تاکنون موفق به جذب ۸ دانشجوی دکتری شامل ۴ دانشجوی دکتری تخصصی پژوهشی و۴ دانشجوی دکتری تخصصی نموده است که ۵ نفر از این تعداد ، فارغ التحصیل شده و ۳ دانشجوی دکتری تخصصی پژوهشی نیز در حال تحصیل در این مرکز تحقیقات هستند.
دانشجویان دکتری فارغ التحصیل:
دانشجویان دکتری در حال تحصیل:
این مرکز تنها سازمان در نوع خود در آسیا و خاورمیانه است و عضو انجمن بین المللی بیماران مبتلا به نقص اولیه ایمنی( IPOPI) است.